El Consejo Directivo del Instituto está integrado por el Presidente y el Vicepresidente de la Asociación Psicoanalítica Chilena; a éste último le corresponden las funciones de coordinación del Instituto con la Asociación y actuará de Secretario del Instituto, por el Director del Instituto, él que será elegido cada dos años por la Junta General Ordinaria de la Asociación de entre sus miembros titulares y que podrá ser reelegido y por cuatro Coordinadores que serán elegidos cada dos años por la Junta General Ordinaria de entre los miembros Titulares y/o Asociados de la Asociación que integran los Comités del Instituto.
